conda
conda信息
查看conda版本，源，路径…
conda更新
更新到最新版本
conda安装Python包
conda install PACKAGENAME
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conda创建新环境
conda create --name 环境名 python=版本号
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激活/关闭环境
WINDOWS: activate 环境名
LINUX, macOS: source activate 环境名
最新版
conda activate 环境名
关闭只需把activate改为deactivate
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列出所有环境
复制环境
conda create --clone 环境名 --name 环境名2
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列出已安装的包
删除某个环境
conda env remove --name 环境名
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把环境保存到文本文件中
conda list --explicit > bio-env.txt
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从文本文件中创建环境
conda env create --file bio-env.txt
经测试这样会报错，推荐重新创建一个空环境，再导入环境，如下
conda install --file bio-env.txt
第二种方法
conda env export > environment.yaml
conda env create -f environment.yaml
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从某个源中安装Python包
conda install --channel conda-forge源 包名
//清华anaconda镜像：
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/pytorch/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/menpo/
conda config --set show_channel_urls yes
//中科大anaconda镜像：
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/menpo/
conda config --set show_channel_urls yes
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jupyter
打开JupyterNotebook
jupyter notebook
该命令会把命令行打开的目录作为起始目录
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计算单元的执行时间
在一个jupyter notebook单元的开头使用%%time命令
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运行不同的编程语言
%%bash
%%HTML
%%python2
%%python3
%%ruby
%%perl
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其他命令有待发掘
jupyter官方文档
jupyter简单使用
jupyter简单使用2
Markdown使用
HTML5
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- 本文作者: 聆听·彼岸
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